国家植物园体系建设在植物迁地保护、科学研究、科普教育等方面发挥重要作用。2023年，国家林草局会同有关部门联合印发《国家植物园体系布局方案》，在已设立2个国家植物园基础上，再遴选出14个国家植物园候选园纳入空间布局，新疆伊犁—吐鲁番国家植物园位列其中。

自治区林业和草原局党委书记、副局长张志刚介绍，新疆地域辽阔、地貌丰富，特别是中科院吐鲁番沙漠植物园科研基础扎实，有2000多种干旱植物、盐生植物、高原山地植物，建立了20多个专业园。我区建立国家植物园优势明显。今年，我区将加强以国家公园为主体的自然保护地体系建设，争取2026年提出设立国家植物园申请。

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吐鲁番沙漠植物园隶属于中国科学院新疆生态与地理研究所，前身是吐鲁番红旗治沙站，建立于1972年。建站之初，面对严峻的“沙进人退”困境，应吐鲁番人民政府要求，建立防护林带及防风固沙示范样板区，有效阻滞风沙进一步前移；在此基础上进一步广泛收集荒漠植物并进行引种驯化，建立吐鲁番沙漠植物园。

目前，吐鲁番沙漠植物园已成为中亚荒漠植物资源（物种、基因）储备库、我国荒漠植物多样性迁地保护与可持续利用研究基地和国家科普教育基地。先后被授予“国家级青少年科普教育基地”、“自治区青少年科技教育基地”、“全国野生植物保护科普教育基地”、“生物多样性保护示范基地”等称号，是国家级青少年科普教育基地及荒漠植物科学研究的理想场所。

伊犁植物园位于新源县野果林改良场，距离新源县城以东28公里处，拥有原始野生果林2万亩。植物园由中国科学院新疆生态与地理研究所建设，其中有占地面积300多亩的观赏花卉园、药用植物园、经济果木园，目前，建设中的特有和珍稀濒危植物园已初具规模。